提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
浙江新春见闻：乡村咖啡馆里“喝”出别样年味******
(新春走基层)浙江新春见闻：乡村咖啡馆里“喝”出别样年味
中新网宁波1月26日电(记者 林波)将打好的奶泡倒入咖啡液中，随后左右晃动，杯子里慢慢呈现出一个“之”字奶泡痕迹……1月26日，在浙江省宁波市奉化区蒋家池头村，伴随着客户的点单声，店主陈梦琴正忙着一边制作咖啡，一边回复客户。
乡村咖啡馆“爆单”了，这是陈梦琴这个春节没有想到的事。
“之前生意也不错，但没想到能有如此火热的场景。”陈梦琴表示，春节期间，每日下午是店内最忙碌的时间段，“下午可以卖出上百杯咖啡，座无虚席，很多人还在排队等位。”
陈梦琴的壹伴咖啡于2022年7月开业。彼时，在外做服装生意的她在该村党支部书记陈伦的招引下，决定回村创业，在村口开了一家乡村咖啡馆。
除了咖啡外，她还提供蛋糕等甜品，“村子里生活节奏舒适，关键是客流量并不小，村子里的‘60后’‘70后’空了也会来喝一杯咖啡，吃一块蛋糕，再晒晒太阳打打毛衣。”
春节期间，这家乡村咖啡馆却“喝”出了城市大IP的客流。
据陈梦琴介绍，新增的客流大多是外来客人和本村返乡村民，“年轻客人特别多，咖啡馆还有桌子，他们可以在这里聊天、玩游戏。”
遇见·永旺咖啡馆一景。 受访者供图“没想到村里也有咖啡馆，下午是打瞌睡的时候，正好来杯咖啡提神。”前来旅游的“95后”游客曾心怡接受采访时表示，她和几个好友一起出来玩，正好可以在咖啡馆聊天。
在宁波市镇海区永旺村，稻田收割后的一片灰黄和蓝天白云交织在一起，组成了一幅冬日美景图。
遇见·永旺咖啡馆便坐落于此。
手持一杯咖啡，在推开窗便是稻田的窗前拍照……这是当地市民林曾的新年“打卡”剪影。
“拍一组乡村野趣与自然浪漫并存的新年照片。”林曾接受采访时表示，在春节假期行程表上，这家乡村咖啡馆是必“打卡”项目，“只要一杯咖啡就可以享受天幕、椅子等露营设备，既适合春节约朋友玩，也适合拍照。”
据遇见·永旺咖啡馆馆长裘俊杰介绍，春节期间，该咖啡馆仍保持营业状态，“每日9时至19时是我们的营业时间，一般下午是客流高峰，多的时候可以卖出300多杯咖啡。”
遇见·永旺咖啡馆一景。 受访者供图永旺村党委书记郭诚军于此前接受记者采访时表示，这里原来是一块农用设施房用地，经常有人偷倒垃圾，味道很大，“为了改变村容村貌，村里变废为宝，将其打造成花海风景，提高了乡村颜值。”
通过打造乡村咖啡馆，原本“平平无奇”的永旺村，一夜间声名鹊起。通过咖啡馆的引流，该村人气增加了，村民的手工艺品、土特产在家门口实现售卖。
与此同时，永旺村还在村里打造了游乐设施、民宿等要素，形成了新的乡村产业链，带动乡村振兴。
事实上，作为一种新型业态，乡村咖啡馆不仅为乡村吸引了年轻人，也为乡村振兴增加了亮点。
绍兴市岭南乡的三个月亮乡村咖啡馆、余姚市柿林村的老柿林咖啡馆、宁海县骆家坑村的绿岛咖啡屋……越来越多的咖啡馆出现在浙江乡村。特别是在春节期间，这些咖啡馆正展现着别样年味。(完)
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